一位名叫霍頓博士（艾蜜莉布朗）發現了深藏在亞馬遜裡，有著一顆擁有治癒神力的奇幻之樹，而要取得這棵樹的神力，必須帶著一個被人類收藏的「神奇箭頭」來解開它，霍頓博士決定要深入叢林，來一探這個傳說的究竟，她找來了一個看似可靠，但其實是個只想詐騙遊客的狡猾渡輪船長—法蘭克船長（巨石強森），她雇用法蘭克載著自己與弟弟（傑克懷特霍爾）前往叢林展開這場解開神秘傳說之謎的旅程。