某個夏天，日本各地接連出現怪異現象而引發騷動。在這之中，野原一家決定要回廣志的故鄉秋田縣老家。在準備行李時，有奇怪的影子正從庭院的暗處偷偷看著無憂無慮地玩著鬼抓人遊戲的小新。

抵達秋田的野原一家，在爺爺．銀之介的家中度過安穩的時光。隔天早上，上面寫著「妖怪假期村」的傳單竟散落在小新一家就寢的房間。

在小新的請求下，野原一家決定前往妖怪假期村，沒想到卻在杳無人煙的深山中闖入一個奇妙的空間，而那裡就是禁止人類進入的「妖怪之國」的入口……